Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KRTAP1-1Q07627 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
KRTAP1-1Q07627 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms