Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CACNG1Q06432 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNG1Q06432 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms