Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TNP2Q05952 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms