Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A2Q05940 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A2Q05940 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A2Q05940 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A2Q05940 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A2Q05940 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A2Q05940 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A2Q05940 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC18A2Q05940 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC18A2Q05940 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC18A2Q05940 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC18A2Q05940 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC18A2Q05940 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms