Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC25A11Q02978 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC25A11Q02978 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms