Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CENPEQ02224 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms