Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRCDQ00LT1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms