Protein–RNA interactions for Protein: P83110

HTRA3, Serine protease HTRA3, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA3P83110 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA3P83110 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA3P83110 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms