Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUCB2P80303 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms