Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX6P78412 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX6P78412 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX6P78412 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX6P78412 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX6P78412 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX6P78412 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRX6P78412 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRX6P78412 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRX6P78412 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRX6P78412 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRX6P78412 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRX6P78412 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRX6P78412 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRX6P78412 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRX6P78412 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRX6P78412 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRX6P78412 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRX6P78412 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRX6P78412 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRX6P78412 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX6P78412 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX6P78412 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX6P78412 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX6P78412 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX6P78412 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX6P78412 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX6P78412 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX6P78412 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX6P78412 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX6P78412 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX6P78412 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX6P78412 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX6P78412 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX6P78412 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX6P78412 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX6P78412 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRX6P78412 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX6P78412 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX6P78412 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX6P78412 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX6P78412 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX6P78412 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX6P78412 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX6P78412 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX6P78412 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX6P78412 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX6P78412 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX6P78412 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX6P78412 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX6P78412 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX6P78412 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX6P78412 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IRX6P78412 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX6P78412 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX6P78412 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX6P78412 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX6P78412 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX6P78412 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX6P78412 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX6P78412 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX6P78412 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX6P78412 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX6P78412 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX6P78412 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX6P78412 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX6P78412 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX6P78412 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IRX6P78412 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
IRX6P78412 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
IRX6P78412 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
IRX6P78412 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX6P78412 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX6P78412 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX6P78412 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX6P78412 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX6P78412 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX6P78412 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX6P78412 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX6P78412 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX6P78412 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IRX6P78412 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRX6P78412 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IRX6P78412 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
IRX6P78412 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRX6P78412 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRX6P78412 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRX6P78412 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRX6P78412 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IRX6P78412 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRX6P78412 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRX6P78412 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRX6P78412 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRX6P78412 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRX6P78412 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IRX6P78412 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX6P78412 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX6P78412 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX6P78412 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IRX6P78412 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms