Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HERVK_113P63132 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HERVK_113P63132 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms