Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP46P62068 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP46P62068 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP46P62068 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP46P62068 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP46P62068 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP46P62068 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP46P62068 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP46P62068 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP46P62068 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP46P62068 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP46P62068 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP46P62068 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP46P62068 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP46P62068 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP46P62068 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP46P62068 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP46P62068 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP46P62068 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP46P62068 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP46P62068 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP46P62068 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP46P62068 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP46P62068 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP46P62068 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP46P62068 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP46P62068 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP46P62068 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP46P62068 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP46P62068 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP46P62068 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP46P62068 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP46P62068 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP46P62068 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP46P62068 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP46P62068 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP46P62068 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP46P62068 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP46P62068 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP46P62068 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP46P62068 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP46P62068 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP46P62068 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP46P62068 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP46P62068 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP46P62068 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP46P62068 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP46P62068 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP46P62068 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP46P62068 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP46P62068 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP46P62068 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP46P62068 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP46P62068 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP46P62068 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP46P62068 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP46P62068 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP46P62068 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP46P62068 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP46P62068 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP46P62068 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP46P62068 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP46P62068 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP46P62068 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP46P62068 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP46P62068 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP46P62068 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP46P62068 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP46P62068 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP46P62068 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP46P62068 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP46P62068 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP46P62068 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP46P62068 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP46P62068 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP46P62068 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP46P62068 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP46P62068 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP46P62068 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP46P62068 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP46P62068 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP46P62068 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP46P62068 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP46P62068 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP46P62068 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP46P62068 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
USP46P62068 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP46P62068 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP46P62068 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP46P62068 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP46P62068 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP46P62068 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP46P62068 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP46P62068 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP46P62068 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP46P62068 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP46P62068 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP46P62068 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
USP46P62068 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP46P62068 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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