Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STX1BP61266 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
STX1BP61266 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
STX1BP61266 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STX1BP61266 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STX1BP61266 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STX1BP61266 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STX1BP61266 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STX1BP61266 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STX1BP61266 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STX1BP61266 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STX1BP61266 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STX1BP61266 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STX1BP61266 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STX1BP61266 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STX1BP61266 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
STX1BP61266 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STX1BP61266 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STX1BP61266 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
STX1BP61266 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
STX1BP61266 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STX1BP61266 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX1BP61266 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX1BP61266 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX1BP61266 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX1BP61266 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX1BP61266 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX1BP61266 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX1BP61266 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX1BP61266 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX1BP61266 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX1BP61266 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX1BP61266 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX1BP61266 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STX1BP61266 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX1BP61266 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX1BP61266 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX1BP61266 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX1BP61266 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX1BP61266 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX1BP61266 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX1BP61266 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STX1BP61266 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX1BP61266 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX1BP61266 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX1BP61266 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX1BP61266 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX1BP61266 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX1BP61266 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX1BP61266 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX1BP61266 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STX1BP61266 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms