Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNAP25P60880 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP25P60880 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms