Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPI1P60174 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPI1P60174 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPI1P60174 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPI1P60174 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPI1P60174 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TPI1P60174 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPI1P60174 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPI1P60174 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPI1P60174 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPI1P60174 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPI1P60174 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPI1P60174 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPI1P60174 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPI1P60174 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPI1P60174 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPI1P60174 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPI1P60174 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPI1P60174 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPI1P60174 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPI1P60174 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPI1P60174 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPI1P60174 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPI1P60174 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPI1P60174 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPI1P60174 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPI1P60174 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TPI1P60174 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPI1P60174 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPI1P60174 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPI1P60174 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TPI1P60174 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPI1P60174 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPI1P60174 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPI1P60174 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPI1P60174 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPI1P60174 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPI1P60174 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPI1P60174 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPI1P60174 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPI1P60174 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPI1P60174 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPI1P60174 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPI1P60174 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPI1P60174 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPI1P60174 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPI1P60174 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPI1P60174 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPI1P60174 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPI1P60174 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TPI1P60174 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPI1P60174 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPI1P60174 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPI1P60174 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPI1P60174 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPI1P60174 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPI1P60174 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPI1P60174 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPI1P60174 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPI1P60174 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPI1P60174 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPI1P60174 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TPI1P60174 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPI1P60174 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPI1P60174 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPI1P60174 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPI1P60174 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPI1P60174 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPI1P60174 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPI1P60174 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPI1P60174 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPI1P60174 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPI1P60174 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPI1P60174 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPI1P60174 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPI1P60174 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPI1P60174 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPI1P60174 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TPI1P60174 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPI1P60174 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPI1P60174 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPI1P60174 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPI1P60174 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPI1P60174 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPI1P60174 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPI1P60174 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPI1P60174 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPI1P60174 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPI1P60174 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TPI1P60174 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPI1P60174 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TPI1P60174 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPI1P60174 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPI1P60174 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPI1P60174 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPI1P60174 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPI1P60174 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPI1P60174 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPI1P60174 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPI1P60174 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms