Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NLRP11P59045 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRP11P59045 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms