Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BACE1P56817 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BACE1P56817 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BACE1P56817 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BACE1P56817 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BACE1P56817 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BACE1P56817 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BACE1P56817 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BACE1P56817 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BACE1P56817 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BACE1P56817 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BACE1P56817 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BACE1P56817 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BACE1P56817 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BACE1P56817 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BACE1P56817 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BACE1P56817 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BACE1P56817 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BACE1P56817 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BACE1P56817 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BACE1P56817 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BACE1P56817 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BACE1P56817 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BACE1P56817 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BACE1P56817 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BACE1P56817 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BACE1P56817 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BACE1P56817 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BACE1P56817 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BACE1P56817 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BACE1P56817 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BACE1P56817 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BACE1P56817 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BACE1P56817 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BACE1P56817 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BACE1P56817 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BACE1P56817 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BACE1P56817 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BACE1P56817 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BACE1P56817 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BACE1P56817 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BACE1P56817 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BACE1P56817 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BACE1P56817 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BACE1P56817 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BACE1P56817 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BACE1P56817 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BACE1P56817 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BACE1P56817 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BACE1P56817 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BACE1P56817 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BACE1P56817 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BACE1P56817 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BACE1P56817 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BACE1P56817 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BACE1P56817 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BACE1P56817 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BACE1P56817 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BACE1P56817 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BACE1P56817 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BACE1P56817 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BACE1P56817 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BACE1P56817 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BACE1P56817 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BACE1P56817 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BACE1P56817 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BACE1P56817 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BACE1P56817 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BACE1P56817 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BACE1P56817 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BACE1P56817 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BACE1P56817 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BACE1P56817 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BACE1P56817 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BACE1P56817 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BACE1P56817 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BACE1P56817 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BACE1P56817 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BACE1P56817 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BACE1P56817 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BACE1P56817 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms