Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCL23P55773 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL23P55773 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL23P55773 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL23P55773 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL23P55773 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL23P55773 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL23P55773 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL23P55773 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL23P55773 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCL23P55773 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCL23P55773 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL23P55773 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL23P55773 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL23P55773 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL23P55773 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL23P55773 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL23P55773 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL23P55773 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL23P55773 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL23P55773 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL23P55773 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL23P55773 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL23P55773 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL23P55773 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL23P55773 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCL23P55773 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCL23P55773 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL23P55773 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL23P55773 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL23P55773 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL23P55773 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL23P55773 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL23P55773 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL23P55773 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL23P55773 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL23P55773 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL23P55773 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL23P55773 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCL23P55773 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCL23P55773 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCL23P55773 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCL23P55773 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms