Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP7P55210 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASP7P55210 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP7P55210 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP7P55210 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP7P55210 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP7P55210 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP7P55210 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP7P55210 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP7P55210 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP7P55210 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP7P55210 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP7P55210 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP7P55210 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP7P55210 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASP7P55210 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP7P55210 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP7P55210 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP7P55210 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP7P55210 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP7P55210 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP7P55210 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP7P55210 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP7P55210 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP7P55210 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP7P55210 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASP7P55210 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASP7P55210 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASP7P55210 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP7P55210 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP7P55210 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP7P55210 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP7P55210 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASP7P55210 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CASP7P55210 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CASP7P55210 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASP7P55210 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP7P55210 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP7P55210 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP7P55210 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP7P55210 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASP7P55210 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms