Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF1P55201 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF1P55201 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms