Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AIF1P55008 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AIF1P55008 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AIF1P55008 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AIF1P55008 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AIF1P55008 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AIF1P55008 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AIF1P55008 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AIF1P55008 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AIF1P55008 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AIF1P55008 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AIF1P55008 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AIF1P55008 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AIF1P55008 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AIF1P55008 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AIF1P55008 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AIF1P55008 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AIF1P55008 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AIF1P55008 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AIF1P55008 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AIF1P55008 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AIF1P55008 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AIF1P55008 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AIF1P55008 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AIF1P55008 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AIF1P55008 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AIF1P55008 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AIF1P55008 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AIF1P55008 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AIF1P55008 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AIF1P55008 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AIF1P55008 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AIF1P55008 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AIF1P55008 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AIF1P55008 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AIF1P55008 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AIF1P55008 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AIF1P55008 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AIF1P55008 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AIF1P55008 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AIF1P55008 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AIF1P55008 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIF1P55008 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIF1P55008 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIF1P55008 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIF1P55008 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIF1P55008 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIF1P55008 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AIF1P55008 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIF1P55008 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIF1P55008 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIF1P55008 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIF1P55008 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIF1P55008 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIF1P55008 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIF1P55008 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIF1P55008 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AIF1P55008 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AIF1P55008 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIF1P55008 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIF1P55008 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIF1P55008 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIF1P55008 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIF1P55008 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIF1P55008 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIF1P55008 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIF1P55008 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIF1P55008 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIF1P55008 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIF1P55008 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIF1P55008 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIF1P55008 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIF1P55008 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIF1P55008 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AIF1P55008 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AIF1P55008 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AIF1P55008 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AIF1P55008 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AIF1P55008 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AIF1P55008 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms