Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LBX1P52954 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LBX1P52954 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LBX1P52954 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LBX1P52954 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LBX1P52954 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LBX1P52954 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LBX1P52954 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LBX1P52954 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LBX1P52954 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LBX1P52954 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LBX1P52954 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LBX1P52954 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LBX1P52954 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LBX1P52954 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LBX1P52954 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LBX1P52954 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LBX1P52954 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LBX1P52954 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LBX1P52954 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LBX1P52954 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LBX1P52954 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LBX1P52954 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LBX1P52954 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LBX1P52954 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LBX1P52954 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LBX1P52954 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LBX1P52954 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LBX1P52954 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LBX1P52954 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LBX1P52954 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LBX1P52954 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LBX1P52954 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LBX1P52954 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LBX1P52954 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LBX1P52954 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LBX1P52954 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBX1P52954 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBX1P52954 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBX1P52954 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LBX1P52954 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBX1P52954 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBX1P52954 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBX1P52954 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBX1P52954 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBX1P52954 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBX1P52954 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LBX1P52954 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBX1P52954 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBX1P52954 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBX1P52954 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBX1P52954 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBX1P52954 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LBX1P52954 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LBX1P52954 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LBX1P52954 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LBX1P52954 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LBX1P52954 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LBX1P52954 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LBX1P52954 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LBX1P52954 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LBX1P52954 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LBX1P52954 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LBX1P52954 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LBX1P52954 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LBX1P52954 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LBX1P52954 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LBX1P52954 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LBX1P52954 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LBX1P52954 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LBX1P52954 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LBX1P52954 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LBX1P52954 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LBX1P52954 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LBX1P52954 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LBX1P52954 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LBX1P52954 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LBX1P52954 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LBX1P52954 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LBX1P52954 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LBX1P52954 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LBX1P52954 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LBX1P52954 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms