Protein–RNA interactions for Protein: P52943

CRIP2, Cysteine-rich protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2P52943 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP2P52943 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CRIP2P52943 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CRIP2P52943 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms