Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR1P51861 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR1P51861 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR1P51861 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR1P51861 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR1P51861 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR1P51861 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR1P51861 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR1P51861 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR1P51861 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR1P51861 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR1P51861 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR1P51861 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR1P51861 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR1P51861 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR1P51861 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR1P51861 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR1P51861 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR1P51861 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR1P51861 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR1P51861 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR1P51861 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR1P51861 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR1P51861 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR1P51861 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR1P51861 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR1P51861 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR1P51861 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR1P51861 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR1P51861 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR1P51861 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR1P51861 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR1P51861 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR1P51861 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR1P51861 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR1P51861 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR1P51861 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR1P51861 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR1P51861 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR1P51861 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDR1P51861 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR1P51861 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR1P51861 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR1P51861 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR1P51861 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR1P51861 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR1P51861 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR1P51861 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR1P51861 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR1P51861 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDR1P51861 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDR1P51861 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDR1P51861 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDR1P51861 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDR1P51861 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDR1P51861 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR1P51861 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR1P51861 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR1P51861 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR1P51861 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDR1P51861 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms