Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDE6CP51160 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDE6CP51160 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms