Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSEN2P49810 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSEN2P49810 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms