Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX1P48742 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX1P48742 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX1P48742 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX1P48742 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX1P48742 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX1P48742 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX1P48742 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX1P48742 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX1P48742 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX1P48742 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX1P48742 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LHX1P48742 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LHX1P48742 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LHX1P48742 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LHX1P48742 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LHX1P48742 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX1P48742 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX1P48742 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX1P48742 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX1P48742 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX1P48742 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX1P48742 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX1P48742 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX1P48742 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX1P48742 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX1P48742 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX1P48742 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX1P48742 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX1P48742 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LHX1P48742 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX1P48742 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX1P48742 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX1P48742 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX1P48742 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX1P48742 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX1P48742 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX1P48742 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX1P48742 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX1P48742 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX1P48742 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX1P48742 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX1P48742 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX1P48742 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX1P48742 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX1P48742 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LHX1P48742 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX1P48742 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX1P48742 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX1P48742 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX1P48742 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX1P48742 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX1P48742 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX1P48742 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX1P48742 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX1P48742 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX1P48742 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX1P48742 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX1P48742 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHX1P48742 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX1P48742 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX1P48742 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX1P48742 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX1P48742 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX1P48742 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX1P48742 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX1P48742 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX1P48742 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX1P48742 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX1P48742 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX1P48742 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX1P48742 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX1P48742 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX1P48742 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX1P48742 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX1P48742 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX1P48742 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX1P48742 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms