Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NESP48681 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NESP48681 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NESP48681 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
NESP48681 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NESP48681 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NESP48681 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NESP48681 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NESP48681 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NESP48681 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NESP48681 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NESP48681 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NESP48681 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NESP48681 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NESP48681 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NESP48681 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NESP48681 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NESP48681 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NESP48681 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NESP48681 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NESP48681 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NESP48681 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NESP48681 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NESP48681 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NESP48681 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NESP48681 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NESP48681 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NESP48681 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NESP48681 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NESP48681 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NESP48681 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NESP48681 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NESP48681 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NESP48681 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NESP48681 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
NESP48681 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NESP48681 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NESP48681 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NESP48681 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
NESP48681 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NESP48681 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NESP48681 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NESP48681 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NESP48681 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NESP48681 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NESP48681 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NESP48681 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NESP48681 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NESP48681 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NESP48681 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NESP48681 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NESP48681 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NESP48681 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NESP48681 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NESP48681 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NESP48681 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NESP48681 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NESP48681 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NESP48681 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
NESP48681 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NESP48681 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NESP48681 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NESP48681 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NESP48681 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NESP48681 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NESP48681 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NESP48681 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NESP48681 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NESP48681 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NESP48681 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NESP48681 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NESP48681 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NESP48681 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NESP48681 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
NESP48681 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NESP48681 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NESP48681 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NESP48681 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NESP48681 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
NESP48681 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
NESP48681 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
NESP48681 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NESP48681 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NESP48681 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NESP48681 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NESP48681 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
NESP48681 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NESP48681 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NESP48681 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NESP48681 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NESP48681 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
NESP48681 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NESP48681 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NESP48681 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NESP48681 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
NESP48681 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NESP48681 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NESP48681 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
NESP48681 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
NESP48681 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms