Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNT2P45379 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNT2P45379 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms