Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTR1BP42025 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTR1BP42025 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTR1BP42025 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTR1BP42025 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTR1BP42025 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTR1BP42025 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTR1BP42025 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms