Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THPOP40225 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
THPOP40225 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THPOP40225 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THPOP40225 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THPOP40225 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THPOP40225 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THPOP40225 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
THPOP40225 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THPOP40225 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THPOP40225 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THPOP40225 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THPOP40225 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THPOP40225 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THPOP40225 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THPOP40225 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THPOP40225 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THPOP40225 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THPOP40225 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THPOP40225 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THPOP40225 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THPOP40225 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THPOP40225 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THPOP40225 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THPOP40225 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THPOP40225 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THPOP40225 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THPOP40225 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THPOP40225 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THPOP40225 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THPOP40225 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THPOP40225 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THPOP40225 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THPOP40225 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THPOP40225 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THPOP40225 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THPOP40225 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THPOP40225 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THPOP40225 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THPOP40225 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THPOP40225 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THPOP40225 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THPOP40225 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THPOP40225 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
THPOP40225 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THPOP40225 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THPOP40225 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
THPOP40225 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THPOP40225 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THPOP40225 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THPOP40225 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THPOP40225 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THPOP40225 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THPOP40225 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
THPOP40225 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THPOP40225 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THPOP40225 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THPOP40225 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms