Protein–RNA interactions for Protein: P38996

NAB3, Nuclear polyadenylated RNA-binding protein 3, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 802 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NAB3	P38996	STE2	YFL026W	1296 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	SUP56	tL(CAA)A	82 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	SUP53	tL(CAA)C	82 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	tL(CAA)D	tL(CAA)D	82 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	tL(CAA)G1	tL(CAA)G1	82 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	SUP54	tL(CAA)G2	82 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	tL(CAA)G3	tL(CAA)G3	82 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	tL(CAA)K	tL(CAA)K	82 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	tL(CAA)L	tL(CAA)L	82 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	tL(CAA)M	tL(CAA)M	82 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	tL(CAA)N	tL(CAA)N	82 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	YBL068W-A	YBL068W-A	237 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	GIS2	YNL255C	462 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	YAP7	YOL028C	738 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	RIB4	YOL143C	510 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	FAR11	YNL127W	2862 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	ILS1	YBL076C	3219 nt		3.18	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	ALY1	YKR021W	2748 nt		3.17	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	SEC7	YDR170C	6030 nt		3.17	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	YGR053C	YGR053C	852 nt		3.17	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	EST3	YIL009C-A	546 nt		3.17	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	YJR020W	YJR020W	333 nt		3.17	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	RPS29A	YLR388W	171 nt		3.17	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	SGT1	YOR057W	1188 nt		3.17	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	CBP6	YBR120C	489 nt		3.17	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	YKU80	YMR106C	1890 nt		3.17	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	VPS53	YJL029C	2469 nt		3.17	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	PCK1	YKR097W	1650 nt		3.17	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	MFB1	YDR219C	1398 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	UBP16	YPL072W	1500 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	UBC13	YDR092W	462 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	RPA14	YDR156W	414 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	THG1	YGR024C	714 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	YGR050C	YGR050C	357 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	YLL044W	YLL044W	447 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	RGM1	YMR182C	636 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	YNL226W	YNL226W	411 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	YBR062C	YBR062C	543 nt		3.16	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	VTC4	YJL012C	2166 nt		3.15	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	RGA2	YDR379W	3030 nt		3.15	□□□□□ -1.9
NAB3	P38996	YGL218W	YGL218W	651 nt		3.15	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	MTM1	YGR257C	1101 nt		3.15	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	IMP4	YNL075W	873 nt		3.15	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	YBR051W	YBR051W	351 nt		3.15	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	CHA4	YLR098C	1947 nt		3.15	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	YDR239C	YDR239C	2364 nt		3.15	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	TRZ1	YKR079C	2517 nt		3.15	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	TPS2	YDR074W	2691 nt		3.15	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	MRD1	YPR112C	2664 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	ADK1	YDR226W	669 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	PAI3	YMR174C	207 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	ATG3	YNR007C	933 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	YNR034W-A	YNR034W-A	297 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	CRS5	YOR031W	210 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	FLO5	YHR211W	3228 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	GPI13	YLL031C	3054 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	ATG26	YLR189C	3597 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	SAP1	YER047C	2694 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	SWR1	YDR334W	4545 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	PBS2	YJL128C	2007 nt		3.14	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	PSD2	YGR170W	3417 nt		3.13	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	TGL3	YMR313C	1929 nt		3.13	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	SIP3	YNL257C	3690 nt		3.13	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	MPO1	YGL010W	525 nt		3.13	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	RPL27A	YHR010W	411 nt		3.13	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	YJL202C	YJL202C	348 nt		3.13	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	VPH2	YKL119C	648 nt		3.13	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	ACM1	YPL267W	630 nt		3.13	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	ORC2	YBR060C	1863 nt		3.13	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	KRE33	YNL132W	3171 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	SHS1	YDL225W	1656 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	HRD3	YLR207W	2502 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	YCR013C	YCR013C	648 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	PSF1	YDR013W	627 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	RSM28	YDR494W	1086 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	NTF2	YER009W	378 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	PNC1	YGL037C	651 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	YLR307C-A	YLR307C-A	264 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	YLR366W	YLR366W	306 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	SUS1	YBR111W-A	291 nt		3.12	□□□□□ -1.91	RIP-Chip
NAB3	P38996	VPS38	YLR360W	1320 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	SIR3	YLR442C	2937 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	UBX3	YDL091C	1368 nt		3.12	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	IKI3	YLR384C	4050 nt		3.11	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	CDC37	YDR168W	1521 nt		3.11	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	UTP15	YMR093W	1542 nt		3.11	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	LOC1	YFR001W	615 nt		3.11	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	FYV4	YHR059W	393 nt		3.11	□□□□□ -1.91	RIP-Chip
NAB3	P38996	COX3	Q0275	810 nt		3.11	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	ATG27	YJL178C	816 nt		3.11	□□□□□ -1.91	RIP-Chip
NAB3	P38996	RNP1	YLL046C	750 nt		3.11	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	YLR217W	YLR217W	324 nt		3.11	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	IPP1	YBR011C	864 nt		3.11	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	YPL119C-A	YPL119C-A	264 nt		3.11	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	DAL5	YJR152W	1632 nt		3.11	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	INP51	YIL002C	2841 nt		3.1	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	PPX1	YHR201C	1194 nt		3.1	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	YJL047C-A	YJL047C-A	135 nt		3.1	□□□□□ -1.91	RIP-Chip
NAB3	P38996	RPS21A	YKR057W	264 nt		3.1	□□□□□ -1.91
NAB3	P38996	COX8	YLR395C	237 nt		3.1	□□□□□ -1.91

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