Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBRP36941 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBRP36941 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBRP36941 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBRP36941 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBRP36941 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBRP36941 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBRP36941 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBRP36941 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBRP36941 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBRP36941 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBRP36941 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBRP36941 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBRP36941 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBRP36941 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBRP36941 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBRP36941 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBRP36941 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBRP36941 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBRP36941 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBRP36941 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBRP36941 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBRP36941 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBRP36941 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBRP36941 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBRP36941 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBRP36941 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBRP36941 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBRP36941 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBRP36941 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBRP36941 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBRP36941 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBRP36941 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBRP36941 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBRP36941 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBRP36941 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBRP36941 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBRP36941 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBRP36941 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBRP36941 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBRP36941 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBRP36941 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms