Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP5C1P36542 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5C1P36542 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms