Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRIM23P36406 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM23P36406 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms