Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD13P35453 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD13P35453 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms