Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NF2P35240 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NF2P35240 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NF2P35240 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NF2P35240 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NF2P35240 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NF2P35240 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NF2P35240 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NF2P35240 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NF2P35240 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NF2P35240 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NF2P35240 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NF2P35240 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NF2P35240 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NF2P35240 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NF2P35240 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NF2P35240 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NF2P35240 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NF2P35240 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NF2P35240 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NF2P35240 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NF2P35240 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NF2P35240 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NF2P35240 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NF2P35240 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NF2P35240 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NF2P35240 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NF2P35240 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NF2P35240 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NF2P35240 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NF2P35240 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NF2P35240 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NF2P35240 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NF2P35240 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NF2P35240 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NF2P35240 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NF2P35240 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NF2P35240 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NF2P35240 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NF2P35240 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NF2P35240 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NF2P35240 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NF2P35240 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NF2P35240 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NF2P35240 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NF2P35240 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NF2P35240 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NF2P35240 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NF2P35240 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NF2P35240 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NF2P35240 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NF2P35240 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NF2P35240 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NF2P35240 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NF2P35240 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NF2P35240 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NF2P35240 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NF2P35240 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NF2P35240 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NF2P35240 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NF2P35240 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NF2P35240 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NF2P35240 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms