Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CD40LGP29965 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms