Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HLA-DMAP28067 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HLA-DMAP28067 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms