Protein–RNA interactions for Protein: P26447

S100A4, Protein S100-A4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A4P26447 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
S100A4P26447 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
S100A4P26447 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
S100A4P26447 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
S100A4P26447 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
S100A4P26447 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
S100A4P26447 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
S100A4P26447 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A4P26447 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A4P26447 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A4P26447 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A4P26447 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A4P26447 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A4P26447 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A4P26447 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A4P26447 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A4P26447 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A4P26447 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A4P26447 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A4P26447 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A4P26447 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A4P26447 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A4P26447 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A4P26447 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
S100A4P26447 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A4P26447 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A4P26447 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A4P26447 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A4P26447 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A4P26447 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A4P26447 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A4P26447 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A4P26447 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A4P26447 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A4P26447 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms