Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VAMP1P23763 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms