Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRDP23468 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms