Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALB2P22676 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALB2P22676 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALB2P22676 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALB2P22676 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALB2P22676 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALB2P22676 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALB2P22676 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALB2P22676 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CALB2P22676 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CALB2P22676 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CALB2P22676 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALB2P22676 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALB2P22676 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALB2P22676 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALB2P22676 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALB2P22676 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALB2P22676 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALB2P22676 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALB2P22676 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALB2P22676 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALB2P22676 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALB2P22676 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALB2P22676 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALB2P22676 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALB2P22676 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALB2P22676 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALB2P22676 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CALB2P22676 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALB2P22676 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALB2P22676 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALB2P22676 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALB2P22676 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALB2P22676 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALB2P22676 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALB2P22676 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALB2P22676 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALB2P22676 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALB2P22676 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALB2P22676 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CALB2P22676 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CALB2P22676 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms