Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL17P18621 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL17P18621 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL17P18621 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL17P18621 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL17P18621 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL17P18621 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL17P18621 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL17P18621 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPL17P18621 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL17P18621 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL17P18621 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL17P18621 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL17P18621 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL17P18621 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL17P18621 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL17P18621 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL17P18621 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL17P18621 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL17P18621 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL17P18621 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL17P18621 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL17P18621 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL17P18621 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL17P18621 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL17P18621 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL17P18621 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL17P18621 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL17P18621 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL17P18621 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL17P18621 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL17P18621 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL17P18621 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL17P18621 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL17P18621 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL17P18621 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL17P18621 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL17P18621 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL17P18621 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL17P18621 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL17P18621 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL17P18621 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL17P18621 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL17P18621 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL17P18621 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL17P18621 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL17P18621 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL17P18621 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL17P18621 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms