Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPI1P17947 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPI1P17947 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPI1P17947 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPI1P17947 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPI1P17947 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPI1P17947 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPI1P17947 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPI1P17947 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPI1P17947 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPI1P17947 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPI1P17947 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPI1P17947 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPI1P17947 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPI1P17947 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPI1P17947 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPI1P17947 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPI1P17947 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPI1P17947 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPI1P17947 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPI1P17947 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPI1P17947 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPI1P17947 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPI1P17947 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPI1P17947 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SPI1P17947 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPI1P17947 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPI1P17947 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPI1P17947 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPI1P17947 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPI1P17947 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms