Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD1P17405 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPD1P17405 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms