Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZKSCAN1P17029 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZKSCAN1P17029 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
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