Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CREB1P16220 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CREB1P16220 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CREB1P16220 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CREB1P16220 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CREB1P16220 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CREB1P16220 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CREB1P16220 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CREB1P16220 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CREB1P16220 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CREB1P16220 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CREB1P16220 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CREB1P16220 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CREB1P16220 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CREB1P16220 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CREB1P16220 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CREB1P16220 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CREB1P16220 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CREB1P16220 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB1P16220 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB1P16220 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB1P16220 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB1P16220 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB1P16220 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB1P16220 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB1P16220 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB1P16220 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB1P16220 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB1P16220 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB1P16220 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB1P16220 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB1P16220 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB1P16220 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB1P16220 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB1P16220 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB1P16220 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB1P16220 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB1P16220 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB1P16220 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB1P16220 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB1P16220 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB1P16220 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB1P16220 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB1P16220 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB1P16220 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB1P16220 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB1P16220 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB1P16220 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB1P16220 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB1P16220 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB1P16220 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB1P16220 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB1P16220 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB1P16220 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB1P16220 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB1P16220 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB1P16220 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB1P16220 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB1P16220 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB1P16220 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB1P16220 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms