Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD44P16070 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CD44P16070 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD44P16070 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD44P16070 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD44P16070 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD44P16070 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD44P16070 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD44P16070 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CD44P16070 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD44P16070 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CD44P16070 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD44P16070 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD44P16070 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CD44P16070 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CD44P16070 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CD44P16070 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD44P16070 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD44P16070 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD44P16070 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD44P16070 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD44P16070 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD44P16070 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD44P16070 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD44P16070 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD44P16070 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD44P16070 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD44P16070 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD44P16070 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD44P16070 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD44P16070 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD44P16070 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD44P16070 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD44P16070 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD44P16070 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD44P16070 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD44P16070 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD44P16070 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD44P16070 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD44P16070 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD44P16070 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD44P16070 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD44P16070 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD44P16070 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD44P16070 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD44P16070 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD44P16070 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD44P16070 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD44P16070 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD44P16070 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD44P16070 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD44P16070 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD44P16070 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD44P16070 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD44P16070 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD44P16070 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD44P16070 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD44P16070 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD44P16070 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD44P16070 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD44P16070 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD44P16070 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD44P16070 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD44P16070 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD44P16070 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CD44P16070 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD44P16070 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD44P16070 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD44P16070 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms