Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HLA-DOBP13765 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HLA-DOBP13765 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms